Depuis plusieurs années, les écologistes se sont penchés sur différentes techniques mathématiques et statistiques afin de mieux comprendre et prédire les relations qui lient les espèces entre elles. Certaines méthodes utilisent des propriétés physiologiques ou morphologiques des espèces et d’autres reposent sur des algorithmes d’apprentissage. Même si plusieurs de ces méthodes ont déjà été implémentées (parfois avec R), il n’existe actuellement aucun programme informatique rassemblant ces différentes méthodes. C’est pour combler cette lacune que nous avons développé le package R alien. Ce package R a pour but principal de standardiser l’utilisation des différentes méthodes présentement disponibles pour étudier les relations entre les espèces. En plus d’offrir un cadre d’implémentation flexible, il permettra d’inclure les potentiels nouveaux développements méthodologiques qui émergeront dans le futur. Le tout repose sur la définition d’un standard sur la structure d’entrée des données et de sortie des résultats des modèles. Dans cette présentation, j’illustrerai le fonctionnement de alien en présentant comment utiliser le package avec diverses structures de jeux de données. J’expliquerai aussi comment construire différents modèles permettant d’étudier les relations entre les espèces. Je conclurai la présentation en discutant des développements futurs que nous envisageons pour alien.
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